微生物實驗室一般包括：準備室、微生物培養室、器械消毒及清洗室、天平室、純水室、檢測室、菌種室、貯藏室等。微生物實驗室根據工作領域（食品、藥品、醫療等）和性質（教學、生產、研究、監測等）的不同，實驗室組成和規模有很大差別。

一、微生物實驗室平面布局

微生物實驗室應設置成獨立的區域，與其他實驗室分開，門口設有門禁，非相關人員不得進入，各室根據工作內容合理布局，既方便工作又不互相影響。入口處設置集中式更衣間，培養室根據培養條件和種類不同可設置多間（如霉菌培養室、細菌培養室、固體培養、液體培養等）。

潔凈實驗室：自成一區，安排在實驗室的靠邊角落處，用密封門限制人員的進出，把有潔凈要求的房間設置在人員干擾少的地方，把輔助房間設置在外部。考慮微生物試驗操作流程，把檢測室與洗刷消毒室和培養室相鄰，方便人流與物流的分離。為控制人員的出入（人流），只設有一個密封門進入微生物實驗室主潔凈區，操作人員進入物流走廊然后進入準備間，并從準備間分別經過一更、緩沖進入操作區；經過更衣、風淋、緩沖進入局部百級實驗室。物流則由傳遞窗實現。排風口裝有高效過濾器，送風口裝有高效過濾靜壓箱，室內送排風采用上送下排方式，室內排風單側布置，不得有障礙。余壓閥自動調節室內壓力，保持正壓潔凈狀態。

二、實驗室設計與裝修

1、必須為實驗室安全運行、清潔和維護提供足夠的空間。

2、實驗室墻壁、天花板和地板應當光滑、易清潔、防滲漏并耐化學品和消毒劑的腐蝕。地板應當防滑。

3、實驗臺面應是防水的，并可耐消毒劑、酸、堿、有機溶劑和中等熱度的作用。

4、應保證實驗室內所有活動的照明，避免不必要的反光和閃光

5、實驗室器具應當堅固耐用，在實驗臺、柜和其他設備之間及其下面要保證有足夠的空間以便進行清潔。

6、應當有足夠的儲存空間來擺放隨時使用的物品，在實驗室的工作區外還應當提供另外的可長期使用的儲存間。

7、應當為安全操作及儲存溶劑、壓縮氣體和液化氣提供足夠的空間和設施。

8、實驗室的門應有可視窗，并達到適當的防火等級，最好能自動關閉。

9、安全系統應當包括消防、應急供電、應急淋浴以及洗眼設施。

10、有可靠和充足的電力供應和應急照明，以保證人員安全離開實驗室。

11、設備的設計、建造與安裝應便于操作、易于維護、清潔、清除污染和進行質量檢驗。應盡量避免使用玻璃及其他易碎的物品。